用种子繁殖的中草药，为了防止缺苗，播种量往往较大。为避免幼苗拥挤、遮荫、争夺养分，要拔除一部分幼苗，选留壮苗，使之保持一定的营养面积，这叫间苗。间苗宜早不宜迟，避免幼苗过密生长纤弱，发生倒伏和死亡。
间苗的次数可根据中草药种类而定，播种小粒种子，间苗次数可多些。为防止缺苗，可间苗2～3次后才定苗。播种大粒种子间苗次数可少些，如决明、薏苡等间苗1～2次即可定苗。点播如怀牛膝每穴先留2～3株幼苗，待苗稍大后再进行2次间苗、定苗，每穴留苗1株。
直播或育苗移栽都可能造成缺苗断垄，为保全苗，可选阴雨天挖苗移栽或带土移栽，并进行补苗。应使用同龄幼苗或植株大小一致的苗。
