综合防治
1.培育健壮试管无菌苗：金线莲因生长迟缓，且开花结果不易，难以种子繁殖，因此，生产上通常采用组织培养进行人工繁殖。采用生物组培技术，选择高效培养基，再配合最佳植物生长调节剂，科学合理地进行炼苗，培育健壮试管无菌苗。
2.棚室土壤消毒：金线莲人工栽培主要采用大棚栽培，植前用硫磺或百菌清等烟雾剂进行棚室土壤和空间消毒。
3.合理使用介质：组培苗移栽到大田时，采用谷糠烧到发黑，烧透而不变白做为介质，这谷糠吸水及透水性均佳，且富含 Mg2+、k+ 离子，其蓄积养分的能力可降低无菌状态及移出的苗株遭受病菌危害的机会，并有助于瓶苗适应环境的变化。
4.合理布局：创造有利于金线莲生长，而不利于病虫害发生的最佳外界条件 建设大棚应根据金线莲的生长要求，选择森林茂密的山涧两旁，以保证阴凉，有水灌溉，冬季避风保暖，减少散热，保持湿度、合理整畦，畦高控制在 0.3~0.5m ，保证畦面不积水。合理施肥，多施有机肥及根外追肥提高植株抗病力，空气湿度较高有助于金线莲生长并提高植株鲜重，但栽培介质不宜过湿，过湿易导致软腐病。应注意采取通风透光措施。
病害：
猝倒病 主要为镰刀菌危害引起，病苗茎基部出现黄褐色水渍状病斑，很快发展至绕茎一周，病部组织腐烂干枯溢缩呈线状。病势发展迅速，幼苗迅速倒伏死亡，出现猝倒现象。防治方法：综合防治或用 75% 百菌清可湿性粉剂 600 倍液或 64% 杀毒矾可湿性粉剂 500 倍液或50% 多菌灵可湿性粉剂 600 倍液喷洒。见零星病苗就应喷药以提高防治效果，每 7~10 天喷一次，连喷 2~3 次。
软腐病 属细菌性病害，主要为害中下部内茎和近地表叶片的叶柄。发病初期很难察觉，中期病症在茎基约 3cm 的表皮外出现褐色的坏死斑，叶脉上出现褐色湿腐。植株中下部叶发黄，高温下呈萎蔫状，后期表现为全株蔫枯，直立不倒状，用手轻折即断。防治方法：综合防治；及生物防治：喷新植要素；浓度200毫升/升或农抗751水剂100倍液；雨前、雨后或浇水后及时喷洒14%络氨铜水剂300倍液，或77%可杀得可湿性粉剂500倍液，或50%琥胶硫酸铜可湿性粉剂500倍液
虫害：
蜗牛、蛞蝓
吃金线莲柔软组织如根端、嫩芽等，严重影响生长。防治方法：物理防治，对大棚通风口设置防虫网，减少害虫进入棚室为害的机会；生物防治：利用细菌、真菌、病毒、植物浸提液、抗生素等制成的生物农药来杀灭虫。
红蜘蛛及螨类
以成虫和若虫在叶片上吸取汁液，造成被害叶面出现黄色小点，严重时变黄枯焦，直至脱落，植株枯死。防治方法：物理防治；生物防治：20%复方浏阳霉素1000倍液或阿维苏2000 倍液；化学防治：10% 虫螨灵 3000 倍液或20% 甲氰菊脂乳油 2000 倍液进行喷雾。
小地老虎
3 龄前幼虫取食金线莲的心叶、叶片吃成小刻口或呈网孔状，3 龄后幼虫将金线莲幼苗从近地面的嫩茎咬断，造成缺苗断垄。防治方法：物理防治；诱捕：设置糖醋液诱杀盆诱杀小地老虎等害虫。糖、醋、酒、水比例为 3:4:1:2，糖醋液须加入少量杀虫剂（ 乐斯本或三唑磷）白天盖好，晚上掀起。清晨被咬断幼苗附近的表土，顺行捕捉，可捉到潜伏的 3 龄以后的小地老虎幼虫。另一诱捕：90%敌百虫晶体150g，加1~1.5L水，再拌入碾碎炒香的麦麸5kg 制成毒饵，傍晚撒在苗根附近诱杀。化学防治：用 90% 敌百虫晶体 100 倍液进行灌根。
蝼蛄
在土中咬食幼苗根茎，呈乱麻状断头，造成幼苗死亡，并使土表层窜成许多隆起的隧道，使幼苗根与土壤分离，失水干枯死亡。防治方法：物理防治；生物防治；5% 辛硫磷颗粒剂 1~1.5kg 加细土20~30kg混匀，撒于定植沟内，或用 80% 敌敌畏乳油1000 倍液灌根。
