无公害中药GAP生产基地对大气质量的基本要求，一般均应远离城镇及污染区，大气质量较好且相对稳定。在中药生产基地的上方风向区域内，要求无大量工业废气污染源；要求基地区域内气流相对稳定，即使在风季，其风速也不会太大，因此可选择一些四面环山的河谷地带；要求基地内空气尘埃减少，空气清新洁净，雨水污染少，pH值适中，清澈无色，基地内所使用的塑料制品无毒、无害、不污染大气。地上部分入药的植物，其生产基地应远离交通干道100m，或周围设有防尘林带。
当然，在上述考察具备后，其具体的环境质量认定工作，还要由中国绿色食品发展中心授权的专门检测单位提供检测报告。大气质量经采样分析，对其结果在规定标准范围内即可。
大气环境执行GB3095—82标准的二级，例如日平均总悬浮微粒0.5≤mg/m3，二氧化硫日平均≤0.25 mg/m3，氮氧化物日平均≤0.15 mg/m3，一氧化碳日平均≤6.0 mg/m3，1级的大气综合污染指数应小于0.6；2级在0.6~1之间；3级在1~1.9之间；4级在1.9~2.8之间；4级则在2.8以上，3级和3级以上的大气环境不适合于GAP中药材的无公害生产。
