便秘定义结肠中硬而干燥的粪便滞留导致的排便频率下降或排便困难，一周排便频率少于3次。在急性便秘中，如果得到及时的治疗，急性便秘不一定会发展为慢性便秘，因为大肠的短暂扩张不一定会导致永久性的功能丧失。
慢性便秘被定义为连续至少3周排便次数稀少。而顽固性便秘是便秘更严重的一种形式，与结肠功能的永久性丧失有关。而巨结肠是结肠功能障碍的终末期表现，而这最主要发生在猫中。
便秘的临床定义为偶见并可逆的粪便滞留，顽固性便秘称为永久但可逆的结肠功能消失，而巨结肠症则为永久且不可逆的结肠扩张。
首先，应区梗阻性（即肠壁外、肠壁内或肠腔内）原因和非梗阻性（即炎症性、神经源性、代谢性、药理性、环境性或行为因素）原因。
在这些类别中，鉴别诊断包括营养、代谢、神经、内分泌疾病；骨盆、结肠或直肠的创伤以及结肠或肛门直肠的原发性炎症或肿瘤性疾病；
不溶性纤维含量低的饮食也会降低结肠蠕动；
低血钾、高血钙、低血镁、长期脱水状态和异食癖（异食癖通常继发于行为障碍或慢性肠病）也会如此；
患有导致多饮/多尿的疾病（例如慢性肾病、糖尿病、甲状腺机能亢进）的动物通常也会出现便秘；
患有先天性脊髓损伤和直肠肛门异常（锁肛）的宠物也容易便秘；
腰椎和骶骨节段或骨盆管的创伤通常会导致便秘并伴有里急后重；
严重的前列腺肥大可能会引起肠管外梗阻；
自主神经功能障碍是一种罕见的疾病，在猫中更常见，但也有在犬中有所记录；
甲状腺功能减退的犬猫（尤其是患有先天性甲状腺功能减退的小猫），可能会由于甲状腺激素对于正常肠道的蠕动的影响而便秘；
肥胖以及长期不活动也会减慢结肠通过时间（在住院动物中，便秘可能是多因素问题(例如由于基础疾病(如胰腺炎）导致身体活动减少加上结肠蠕动减慢；
或因使用阿片类药物进行治疗；
在找不到主要病因的病例会被认为是特发性的。
在一项对患有慢性便秘的猫的回顾性研究中，有62%患的是特发性疾病；肠壁外梗阻第二大常见病因（23%）（如骨盆腔狭窄）；神经源性（6%）以及特定品种变化（如曼岛猫的脊髓损伤，5%）；由于肿瘤或医源性因素（如结肠固定术）导致的病例较少；有2%的猫怀疑存在结肠神经节细胞减少或缺失。
患病猫通常在数天数周或数月内表现出无排便、排便减少或排便痛苦的情况。其他临床症状可能包括因大肠刺激在排便时出现血迹，在慢性病例中因厌食导致体重减轻以及因结肠牵引感受器受刺激而出现呕吐。
在便秘的动物中体格检查是十分重要的，腹部触诊可能会发现便秘的迹象，这在小型犬猫身上最明显，而在一些肥胖的动物或者大型动物上则较难发现，应留意有无脱水的迹象，体重减轻以及腹痛的情况。应该仔细查看肛门生殖器区域是否存在疼痛性病变，这或许能够解释动物疼痛性便秘的原因。
在所有便秘的动物都应该进行直肠检查（如有需要可使用镇静剂）。直肠检查对于确定直肠肛管梗阻情况至关重要，应仔细触诊骨性骨盘环，以检测是否可能存在狭窄。直肠检查还可能发现异物、粪石、粪便质地、憩室、狭窄、会阴疝或肿瘤问题。可能需要通过改变动物体位重复进行直肠检查，以确定动态性狭窄。
应仔细进行神经系统和骨科检查，以评估脊髓尾端反射以及自主神经系统。
便秘动物的常规实验室检查结果往往无明显异常。但是还是会建议进行全血细胞计数CBC、血清生化指标检测以及尿液分析，以确定是否存在可能的代谢紊乱等原发病因。（例如血液浓缩，电解质紊乱，如高钙血症或低钾血症。）
应评估甲状腺功能，（T4、促甲状腺激素）因为便秘是甲状腺机能减退的常见临床症状，尤其在患有先天性甲状腺功能减退症的猫咪上面。
腹部X光是便秘必须要进行的一个检查。对于确定结肠的大小以及识别结肠中粪便量和不透现的异物，前列腺肥大，腹部淋巴结病变、骨盆和椎管骨折以及有时管腔内或管腔外的肿物都非常有用。有时需要进行造影检查或荧光透视检查，以评估结肠或直肠狭窄的存在。如果在普通X光片检查后会确定潜在病因，腹部超声和结肠镜检。将是获得明确诊断的下一步。
腹部超声检查可能会显示肠系膜淋巴结肿大，提示慢性炎症性结肠刺激所致。可能会看到结肠壁的局灶性肿块肿瘤，在这个情况下，下一步可能需要进行直肠镜检查，并采取活检样品进行组织病理学检查。内镜检查还有助于发现气势狭窄或结肠粘膜炎症，
对于存在神经系统改变的动物可能需要额外进行横断面成像检查如CT和MRI，而要诊断先天性神经节细胞缺失症，就需要进行肛门直肠测压以及对组织标本进行组织病理学检查。
但是便秘发作不一定需要治疗，然而反复出现便秘的，其次需要进行医学治疗，如果便秘不是特发性的，就应找出并处理潜在疾病。
通常轻度治中度便秘，可以在门诊通过饮食调整以及使用泻药或灌肠进行治疗，也可以使用出肠动力药，对于严重便秘的病例，首先需要通过住院治疗，在麻醉状态下进行灌肠并手动清除粪便之后再进行门诊治疗以防止便秘复发。
如果患有巨结肠的猫，在药物治疗效果不佳时，则需要进行肠全结肠切除术。
内科治疗包括治疗潜在的疾病及饮食调节，口服泻药和促进胃肠道动力的药物组合，对于结肠炎具有一旦一定蠕动力的慢性便秘病，食用不溶性或融合纤维可能是有所帮助的，若是顽固性便秘病患的结肠运动模式已经完全消失了，不应使用不可发酵的高纤维食物，因为这些食物可能会让症状恶化，因使用具有高能量，高密度和高消化率的低渣饮食，以显著减少粪便量，如果动物过重则应考虑减重计划。
刺激结肠内液体积聚，从而增强肠道蠕动。
纤维制剂通常有吸收不良的多糖和车前子所组成，它们既可以作为饮食成分，也可以作为补充剂。例如每餐服用1-4茶匙车前子（5-20ml)或1-4汤匙（15-60ml）南瓜。只有当动物水分充足且有进食时，这些药物才会有效对于已经出现。巨结肠的患者应避免使用纤维补充剂也应喂食低残渣食，以便减少粪便的产生量。
这类泻药包括不可消化的多糖（例如乳果糖）、镁盐（例如硫酸镁、氢氯化镁）以及聚乙二醇。其中乳果糖是这类泻药中效力最强且最常用的一种(0.5-2ml/kg,口服，每8-12小时一次）。有经由鼻试管输注24-48小时的聚乙二醇溶液对患有自发性巨结肠症并造成顽固性便秘的猫非常有效而不需要灌肠。
这类可以诱导推进性蠕动。比沙可啶是对猫最有效的泻药（猫，5mg/只，口服，每天一次）。但是不可以长期服用，因为长期服用会导致肠肌间神经丛不可逆的损伤。
这类泻药有助于排便，并干扰结肠对于水的吸收。矿物油是最常用的润滑性泻药，由于口服时很容易误吸，所以这类物质只能用于配合度高且神志完全的清醒。
促肠动力药可能有助于改善轻度复发性或初次复发的中度及重度便秘患者的结肠蠕动情况，然而对于确诊为巨结肠的情况使用促肠动力药。不能期望获得显著的临床改善效果。
这些药物可刺激整个胃肠道的蠕动且不良反应相对较少。目前推介使用普鲁卡必利用于此类患宠。
米索前列醇常用于胃肠黏膜保护剂，以预防非甾体类抗炎药引起的胃溃疡。然而其不良反应包括胃肠道转运时间加快和腹泻。在人类中是一种有效的抗便秘药物，在患有难治性便秘的动物上面可能也是有用的。对犬猫进行的体外研究也显示提其对肠道平滑肌有益作用。
虽然雷尼替丁在体外研究中显示出促动力作用，但这一作用在体内尚未得到证实，所以这类药物不应用于治疗便秘。
嵌塞粪便可通过直肠栓剂、灌肠以及手动方式清除。
甘油或比沙可啶制成的直肠栓剂只能用于配合度高的动物，可单独使用，也可与口服泻药一起使用。
灌肠更为常用大型犬使用温水，小型犬猫使用生理盐水剂量为10毫升/kg通过柔软的直肠导管注入。可添加矿物油和乳果糖，决不能对猫和小型犬使用含磷酸钠的灌肠剂，因为这可能会导致严重甚至致命的电解质紊乱(例如高钠血症、高磷血症、低钙血症)以及危及生命的脱水情况，在灌肠的时候可能还需要手动清除结肠内的粪便。
对于患有巨结肠的猫药物治疗通常效果不佳，结肠切除是不是唯一合理的治疗方法，在结肠切除术后存活下来的猫预后良好，尤其是在回盲瓣得以保留的话，不过术后几周内可能会出现自限性腹泻。
传统医学认为便秘主要与大肠的传导功能失常及脾胃和肾的功能失调有关，根据发病特点，分为热秘、寒秘和虚秘三类。会配以不同的中药方剂和针灸进行治疗。对慢性功能性便秘治疗效果较好（个人尚未涉猎）。
