中药材与一般农作物的种质研究在核心目标、评价体系、遗传特性及生态要求等方面存在本质区别。这些区别源于中药材作为“具有治疗作用的特殊农产品”的根本属性。具体表现如下：
一、核心育种目标不同
五、其他特殊的考虑因素
1. 物种多样性。中药材基源复杂，一药多源（如黄精、贝母来源于不同物种），种质研究需涵盖多个物种。
2. 繁殖方式多样。许多中药材为多年生，育种周期极长（如杜仲、黄柏需数年甚至数十年）。
3. 濒危与可持续。大量野生药材资源濒危，种质研究必须与资源保护、可持续利用紧密结合。
4. 传统知识关联。药材的性状（如菊花心、朱砂点）与传统鉴别经验紧密相连，种质研究需尊重和整合这部分知识。 一般农作物种质研究是 “生产导向” ，追求在可控条件下，获得数量最大、外观统一、营养稳定的农产品。中药材种质研究是 “质量与疗效导向” ，追求在特定或模拟道地环境下，获得化学组成稳定、生物活性明确、符合传统医学理论的治疗性产品。
因此，将农作物种质的思维直接应用于中药材往往会导致失败。中药材种质研究是一个高度交叉、更复杂、更需要尊重传统知识和生态规律的领域，未来随着野生资源的逐步枯竭，其发展对保障中医药疗效和产业可持续发展至关重要。 1.厘清物种基原，解决“同名异物、同物异名”的混乱问题，建立权威的种质资源身份标识系统。 2.建立国家核心种质资源库、区域性道地药材活体种质圃和种子种苗繁育基地，对珍稀濒危、道地性强的种质进行抢救性保护。 3.建立“品质-活性-临床”关联的多元评价标准，探索建立基于临床疗效反馈的药材品质评价模型。 4.建立国家级中药材种质资源大数据平台，整合种质信息、遗传数据、化学指纹和生态数据，向合规的科研与育种单位开放共享。 5.建立“科研-生产-临床”反馈闭环。鼓励临床医生和药学研究人员反馈药材的临床疗效信息，用以指导和修正育种及种植研究的方向。 6.培养既懂现代生物技术又懂中药传统理论的新一代中药材种业科学家。
